针对目前生物强化处理中存在的问题及菌剂研制与应用领域的热点问题，以炼油废水和印染废水为研究对象，从菌种选育、菌剂研制、菌剂应用三个方面展开了系统研究。建立了高效菌种的快速选育技术－菌落杂交法，选育了高效功能菌株156株，弄清了4株菌的底物代谢途径，获得了7个降解酶基因并验证了其功能；构建了4个品系的9个菌剂，研制出液体、固体两种剂型的菌剂产品并实现高密度发酵，建成了300吨/年的示范性生产线；在完成了菌剂生物强化处理炼油废水中试研究的基础上，完成了炼油废水处理（4800m3/d）与印染废水处理（600m3/d）两个菌剂应用示范工程，可降低废水处理建设成本与运行成本各30%以上，COD、氨氮、色度去除率各提高20%、40%及40%以上，处理出水达标排放并部分回用。